Para el uso de la agenda en org-mode, voy a listar las cosas que uso con frecuencia. Además, en este link hay un resumen de comandos de org-mode muy completo.

Inserción

Atajos de teclado "convencionales" de org-mode (funcionan con Spacemacs).

• capturar una nota en el inbox: C-c c
• links: C-c C-l
• etiqueta de To-Do (empezado, hibernando, completado, etc): C-c C-t
• schedule: C-c C-s
• deadline: C-c C-d

Para agregar:

• Refile: cómo llevar las notas del inbox a su destino final.

Generación de enlaces

Atajos de teclado sólo de Spacemacs.

• buscar dentro de los archivos org (org-occur): SPC a o /
• org-store-link: SPC a o l
• org-insert-link: , i l